My weblog in Persian

Post5. How to start working in Bioinformatics?

پیشنهادات من برای شروع زمینه بیوانفورماتیک به ترتیب اولویت ۱- یادگیری زبان برنامه نویسی پایتون یا آر ۲- مطالعه کتاب های زیست شناسی دبیرستان ۳- زیست شناسی پایه اریک لندر,

کتاب چند جلدی بیولوژی سولمون هم خوب هست که توسط انتشارات خانه زیست شناسی چاپ شده. ۴- دوره بیوانفورماتیک مقدماتی دکتر شریفی زارچی, دو دوره بیوانفورماتیک پیشرفته دکتر شریفی زارچی,

۵- کار با لینوکس ۶- انجام پروژه با استادهای ایرانی در زمینه بیوانفورماتیک ۷- انجام پروژه دورکاری با استاد اروپایی یا آمریکایی ۸- افرادی که مدرک دکتری دارن نوشتن پروپزال با استاد برای دریافت گرنت اروپایی

Post 4. 2021. What is going on in a master program in Tehran?

یک مهر۱۳۹۴ روزیست که من از پایان نامه ی ارشد دفاع کردم. برای من کنکور ارشد واقعا سخت بود، معدل لیسانسم ۱۴ بود که نشون میده پایه خوبی نداشتم. دفعه اول رتبم خوب نشد، یک سالی وقت گزاشتم که رتبه ۳۶۰ اوردم و رشته برق مخابرات دوره شبانه دانشگاه علم و صنعت قبول شدم. مهر ۹۲ من شروع کردم و یک مهر ۹۴ ارشد رو تموم کردم. در کل تو دوره ارشد، هشت تا درس سه واحدی رو اصولا توی سه ترم می گذرونیم. البته برای بعضی ها پیش میاد که چهار یا پنج ترم هم طول بکشه. پاس کردن درسها هم مثل دوره لیسانس هست فقط بهش انجام پروژه و ارائه شفاهی اضافه میشه. البته بعضی استادا خیلی به تدریسشون امیدی نیست و خودمون باید کتاب ۷۰۰ صفحه ای رو بخونیم و مسائلش رو حل کنیم. علاوه بر گذروندن درس ها، سمینار هم داریم که در ترم دوم یا سوم راجب یک موضوعی چندتا مقاله انگلیسی پیدا میکنیم و خلاصه میکنیم و به صورت یک گزارش مثلا چهل صفحه ای می نویسم. مساله ای که اینجا برخورد میکنیم این هست که اصول نوشتن گزارش علمی رو نمی دونیم و نوشتار رو باید به استاد راهنما بدیم و بارها اصلاحاتی که استاد مدنظرش هست رو اعمال کنیم. با توجه به شخصیت استاد، ممکنه این روند یکبار و یا ده بار تکرار بشه. سپس یک روز مشخص با ساختن یک سری اسلاید به صورت شفاهی ۲۰ دقیقه ای در مقابل استادراهنما و یک داور ارائه میدیم و به سوالات اونها جواب میدیم. از وسطای ترم سوم میرسیم به غول مقطع ارشد که پایان نامه یا تز نام داره. هدف از پایان نامه این هست که یک تحقیقی در مدت حدود نه ماه انجام بدیم و یک مساله ای رو حل کنیم و جواب سوالی رو پیدا کنیم. سوالی که پیش میاد این هست که، که چی!؟ کاش بتوانم جواب این سوال رو پیدا کنم، شما میدونین؟ بگذریم... قبل شروع می بایست یک پروپزال حدود ۲۰ صفحه ای آماده کنیم و سوال رو مطرح کنیم‌ و روشی که میخوایم جواب سوال رو پیدا کنیم رو توضیح بدیم. موضوع رو چطور پیدا کنیم؟ راحت نیست! یک ماه باید مقاله ها رو خوند تا یک ایده ی جدیدی پیدا کنیم. راه ساده اش اینکه استاد یا یه دانشجو دکتری ایده ش رو به ما بده! بعد باید پروپزال رو نوشت و همون روند بارها اصلاح توسط استادراهنما برای سمینار در اینجا هم تکرار میشه. مشکل اینجاست که ما هنوز جواب سوال رو نمی دونیم چطور میتونیم روش یافتن جواب رو توضیح بدیم. بعد این پروپزال که استادراهنما تایید کرد گروه اساتید هم یه نگاهی می اندازن و عموما تایید میکنن. خوبه که موضوعی رو انتخاب کنیم که شبیه سمینار باشه، نه اینکه موضوع کاملا جدید. مشکل اساسی این هست که هشت تا درسی که پاس کردیم رو بهتر بود طوری انتخاب میکردیم که برای پایان نامه مفید باشه! خب حالا که سوالی یا مساله ای رو که توی پروپزال گفتیم رو باید جوابش رو پیدا کنیم، چندماه طول میکشه. بودن بچه هایی که بعد یک سال تلاش تمام وقت فهمیدن که جواب سوال توی مقاله ای تازه چاپ شده هست. یا فهمیدن که سوال رو نمیشه جواب داد. این چالش های تحقیق هست. وقتی که مساله ات رو حل کردی به صورت پایان نامه می نویسی و یک روز خاص از چندتا استاد دانشگاه که شاید در موضوع تخصص دارن دعوت می کنی که نحوه ارائه و پایان نامه ات ارزیابی کنن و نمره ای بدهند! بله حالا شما فارغ التحصیل کارشناسی ارشد هستی!

Post 3. 2021. What is going on in a PhD program in Tehran?

یک مهر۱۳۹۴ روزیست که من دوره دکتری رشته برق مخابرات را شروع کردم و پنج مرداد ۹۹ روزیست که از پایان نامه ام به صورت مجازی دفاع کردم. من همزمان با نوشتن پایان نامه ارشد برای کنکور دکتری مطالعه کردم و واقعا هم مثل کنکور های دیگه وقت گزاشتم و رتبه ۱۴ کسب کردم. در دوره ما سوالات کنکور دکتری از درس های کارشناسی ارشد که انگار الان از درس های لیسانس هست. رتبه من خوب بود و بعد از انتخاب رشته دانشگاه شریف تهران علم و صنعت و خواجه نصیر دعوت به مصاحبه شدم و همان دانشگاه ارشدم قبول شد. در دوره دکتری می بایست پنج تا درس را بگذرانیم. در رشته برق درس ها همان درس هایی که برای بچهه های ارشد ارائه می شود. ترم اول دو درس و ترم دوم سه درس برداشتم. در ترم دوم باید یک آزمون زبان انگلیسی بدیم و یک نمره حداقلی داشته باشیم. در ترم سوم آبان ماه یک امتحانی داریم به نام آزمون جامع که به دو صورت شفاهی و کتبی برگزار می شه. طی چند روز می بایست درسها رو به صورت کتبی امتحان بدیم و در آزمون شفاهی طی چند ساعت چند استاد درس ها را به صورت پا تخته! سوال می پرسند. مهمترین بخش مقطع دکتری بخش پژوهش و رساله هست. بعد از اینکه آزمون جامع را با موفقیت تموم کردیم می بایست مثل مقطع ارشد یک پروپزال بنویسیم که میخواهیم در مقطع دکتری در چه زمینه پژوهش کنیم. پروپزال دکتری می بایست بسیار مفصل تر از پروپزال ارشد باشد برای من حدود ۹۰ صفحه بود که شامل پنج ایده برای تحقیق بود. برای نوشتن پروپزال می بایست مقالات متعددی رو مطالعه کنیم که حدود سه تا چهار ماه زمان میبره و ایده های متخلفی رو جهت بهبود مقالات فعلی ارائه بدیم. در رشته ما عموما هر فردی فقط یک استاد راهنما دارد و استاد مشاور ندارد . بعد از روند اصلاح و تکمیل متن پروپزال توسط استاد راهنما می بایست یک جلسه دفاع برگزار شود و دانشجوی دکتری می بایست ایده هایی خود را ارئه کرده و ازآن دفاع کند و اساتید را قانع کند در این جلسه به جز استاد راهنما دو استاد از دانشکده خودمان و دو استاد از دانشگاه های دیگر داور هستند. حالا ترم چهار تمام شده است دو سال از ورود شما به دکتری گزشته است و شما وارد سال سوم دکتری شده اید! شما به شرطی می توانید از دکتر ی فارغ شوید که بتوانید مقاله چاپ کنید .هر چه بیشتر و هر چه با کیفیت تر، راحت تر فارغ می شوید. عموم دانشگاه شرط چپ دو مقاله انگلیسی آی اس آی دارند که استاد بنده شرط چهار مقاله مشخص کرده بود. کار بر روی یک ایده ماه ها زمان میبرد و خیلی از مواقع بعد از چند ماه کار به نتیجه میرسی که ایده جواب نمی دهد یا اینکه فرد دیگری ایده شما را به چاپ رسانده است. وقتی ایده را به نتیجه رساندی می بایست به صورت مقاله بنویسی که اگر زبان انگلیسی ات خوب نباشد چند ماه باید درگیر اصلاحات نگارشی باشد برای من مقاله ای می نوشتم بیشتر از ۴۰ بار برای استاد فرستادهام و اصلاحاتی را انجام داده ام تا مناسب برای ارسال به مجله ای شود. بعد از ارسال به مجله چند داور مقاله را از نظر علمی بررسی میکنند . بعضی داورها سخت گیری بیشتری دارند و بعضی مواقع کل کار را زیر سوال می برند و می بایست اصلاحات مورد نیاز را انجام داده و دوباره برای مجله ارسال کنید این روند برای هر مقاله در حدود شش ماه تا یکسال طول میکشد. بعد از گذشت یکسال از دفاع پروپزال می بایست سمینار میان دوره ای برگزار شود که در آن دانشجو دکتری از نتایج تحقیق خود می گوید و در صورت نیاز درخواست تغییر پروپزال را می دهد. حال که وارد سال چهارم شده ای دیگر توان و رمقی برایت نمانده که بر روی ایده های بزرگ و جدید کار کنی هی به خودت میگویی یه چیزی بنویسی تموم شه بره و ترم آخرم باید دفاع کنم ولی مشکل همینجاست که یه چیزی مینویسی ولی هیچ مجله ای آن را چاپ نمیکند و ریجکت پشت ریجکت! چالش بزرگ اینجاست که شما احتمال ۲۸ ساله ات شده است و حقوقی از دانشگاه دریافت نمی کنی و همچنان همه شما رو به چشم دانشجو می بینند نه محقق. دانشگاه یک سری وام هایی می دهد که بسیار اندک است . دو حالت وجود دارد یا از خانواده ات در این سن پول تو جیبی میگیری یا شروع میکنی به کار کردن در خارج از دانشگاه. مساله تحقیق و پژوهش این هست که می بایست شب ها و روزها با ذهنی باز کاملا درگیر آن باشی تا ایده ها را تجزیه تحلیل کنی در یک لحظه خاص ایده می آيد و می رود . اما با کار کردن نه تنها فرصت تحقیق نداری بلکه انرژی کمتری داری. البته دوستان من هستند که همراه با کار کردن این مسیر رو پیش رفتند اما با سختی فراوان و من آن ها را تحسین می کنم. پس دغدغه مالی خیلی مهم هست که اگر متاهل باشی بسیار سخت تر است. اکثر بچه های دکتری چون حین تحصیل کار میکنند دوره دکتری چهار ساله به شش یا هشت سال طول می کشد. خب حالا که مقالاتت چاپ شد آماده رفتن به جلسه دفاع از رساله دکتری هستی. بعد از سه الی چهار ساعت دفاع، تبریک، شما یک دکتر هستی!

Post 2. 2020. My travel experience from Tehran to Geneva

سلام دوستان تجربه سفر ترکیش ایرلاین تهران به ژنو رو به اشتراک بزارم شاید به کسی کمک کنه. پرواز ما ساعت سه صبح یازده اردیبهشت از فرودگاه امام بود. فاصله بین دو تا پرواز دو ساعت ونیم بود . پروازهای ما تاخیر نداشت. با شرکت سیر وسفر از خونه تا فرودگاه رفتم که ۲۰۰ تومن شد. روز قبل پرواز اینترنتی رزرو وپراخت کردم. یکساعت قبل حرکت موبایل راننده ماشین پیامک شد. دو هفته قبل پرواز بلیط رو ۱۳.۵ میلیون از سایت ترکیش با کارت عابر بانک ایرانی خریدم. همون موقع توی سایتا ۱۲.۵ میلیون بود که انگار نان ریفاندبل بود اگه میخواستم کنسل کنم پولم رو برنمی گردوند. یکی از بچه ها توی گروه گفته بود که بلیطش کنسلی داشت ولی شرکت اذیت میکرد واسه همین تصمیم گرفتم که اصل سایت ایرلاین خرید کنم. یه خوبیه دیگه سایت ترکیش این بود که نرخ کنسلی و شرایط بار رو خیلی واضح نوشته بود که هزینه کنسلی یک میلیون و دویست تومن هست. پرواز ما شنبه صبح بود که ما چهارشنبه صبح آزمایشگاه دکتر ویشکایی تهرانپارس برای تست کرونا رفتیم مرتب و منظم بودن ۳۴۰ تومن گرفتن و هشت شب جواب تست آماده شد پیک هم میکردن تلفن سخت جواب میدن ولی واتساپ هم دارن. چهارساعت قبل پرواز ما به فرودگاه رسیدیم خیلی خلوت بود همون مرحله اول که بار رو پلیس چک میکنه راه نمی دادن. میگفتن هروقت چکاین هواپیمایی باز شد که حدود سه ساعت قبل پرواز بود راه دادن. چک این چند تا آقای بد اخلاق بودن البته اذیت نکردن ولی جواب سوال رو هم نمی دادن. برای چک این، تست پی سی ار و ویزا و فرم پرشده ورودبه کشور سوئیس که تو سایت اداره مهاجرت سویس هست رو از روی گوشیم چک کردن. از نظر بار توی بلیط ما نوشته شده بود نفری ۳۰ کلیو که ما نفری ۳۱کلیو داشتیم گیر ندادن. کری آن روی بلیط نوشته بود ۸ کیلو به همراه یک پرسنال آیتم که تعریف پرسنال آیتم تو سایت ترکیش هست میتونه یک کیف لپتاپ کوچک باشه. کری آن ما هشت ونیم کلیو بود که بهش تگ وصل کرد ولی گفت به خاطر کرونا پرسنال آیتم نمیشه ببرین و شاید دم پرواز بهتون گیر ندن تگ نداد ولی دم پرواز هم کسی کاری نداشت من کیف کوله توش لپتاپ گذاشته بودم با چندتاکتاب که شش کیلو شده بود. توی بار سبزی خشک و چندتا ورق قرص مسکن و سه وعده خورش هانی همراه مون بود که کاری نداشتن. پرواز تهران به استانبول پر بود ولی استانبول به ژنو هفتاد درصد پر بود چندتا ردیف آخر خالی بود. موقع ورود به هواپیما ماسک میدادن. طول پرواز کسی ماسکش رو می اورد پایین تذکر میدادن. اسنک گرم هم حین پرواز دادن که همه یه نیم ساعتی ماسک رو پایین اوردن و میل کردن :دی.توی فرودگاه استانبول قسمت ترانزیت شلوغ بود وسطا جای نشستن نبود ولی اطراف دم گیت جای نشستن با فاصله مناسب بود. یه چایی با یک ونیم یورو خریدیم. برای استفاده از اینترنت توی فرودگاه استانبول یک سری کیوسک بود که با اسکن کردن پاسپورت مثل دستگاه پوز یه پسورد میداد که میشد یکساعت اینترنت رایگان استفاده کرد.

Post 1. 2020. Marie Skłodowska-Curie Actions-Individual Fellowships (IF)

تجربه من از ریجکت در فراخوان ماری کوری رو در اینجا بیان میکنم. ماری کوری یک فیزیکدان و شیمی دان معروف لهستانی بود که در زمینه مواد رادیواکتیو تحقیق و پژوهش می کرد. اتحادیه اروپا برای حمایت از تحقیقات نوین هرساله طی فراخوانی از محققان و دانشمندان دعوت میکنه که پیشنهاده -پروپزال خود رو برای این اتحادیه ارسال کنن. این فراخوان به نام دانشمند بزرگ ماری کوری نامگذاری شده است. این اتحادیه پروپزال ها که شامل موضوع تحقیق و بودجه مورد نیاز هست رو داوری میکنه و تعدادی قبول میشن و می تونن پروژه تحقیقاتی رو شروع کنن. افرادی که مدرک دکتری دارن یا چندین سال تجربه مشابه دارن میتونن با هماهنگی یک استاد میزبان در دانشگاه های اروپا پروپزال رو تهیه و برای داوری ارسال کنن. امسال ۱۱هزار نفر شرکت کردن که حدود هزار نفر قبول شدن. من به دنبال پوزیشن پستداک بودم که دیدم استادی در زمینه پایان نامه دکتری من بیوانفورماتیک پوزیشن داره. توی سایت دانشگاه اپلای کردم و مدتی بعد مصاحبه اسکایپ داشتیم. ولی در مصاحبه گفت که به دنبال فردی هست که چند هفته دیگه شروع کنه و فرد اروپایی میخواد که مسایل ویزا رو نداشته باشه. ولی بهم پیشنهاد داد که می تونیم برای گرنت ماری کوری، پروپزال بنویسیم. بعد چندروز فکر کردم و تصمیم گرفتم که پروپزال بنویسم و تصمیمم رو بهش گفتم. مدتی بعد جلسه گزاشتیم و چند ایده بهم گفت و قرار شد روی یک موضوع کار کنم. کلیت موضوع رو آشنایی داشتم ولی نیاز بود مقالات زیادی بخونم. بعد از دو سه هفته تمام وقت مقاله خوندن باز هم جلسه اسکایپ گزاشتیم و ایده رو بیشتر برایم تشریح کرد و نوشتن رو شروع کردیم. برام یک سری فایل راهنما فرستاد شامل نمونه پرپوزال سال قبل همکارش که ریجکت شد همراه با نظرات داوران و یک سری فایل راهنما درباره نحوه نوشتن پروپزال گرنت. حدود دو ماه تمام وقت حتی شب ها و آخر هفته ها مشغول بودیم با گوگل داک می نوشتم و هر چند روز نوشته من را میخواند و اصلاح می کرد. و هر هفته جلسه داشتیم. ددلاین فراخوان شهریور هست که ما از دو ماه قبلش شروع کردیم. بعد از حدود پنج ماه در بهمن ماه نتایج آمد که پروپزالم نمره ۷۹.۸ گرفت و قبول نشد نمره قبولی بالای ۹۲ بود. درصورت قبولی حقوق ماهانه حدود چهار الی شش هزار یویو برای دو سال پرداخت میشه. در اینترنت نمونه رزومه و پروپزال افرادی که قبول شدن هست میتونین پیدا کنین. موفق باشید.